靶向代谢组学(Targeted metabolomics)是对目标明确的代谢产物的检测分析,特别针对一种或几种途径的代谢产物。需要预先筛选出验证确认的代谢物或已鉴定的潜在生物标记物,基于LC-MS/MS或GC-MS平台采用分析标准品开发稳定的检测方法,进行准确的定性定量分析。
可检测物质:
技术特点:
方法特异性强:只针对明确的目标代谢物进行方法设置及优化;
定量准确度高:定量的基础建立在严格的标准品对应的标准曲线之上。
实验流程
送样指导
样品名称
推荐送样量
植物叶片
1g
植物茎杆
1g
植物根系
1g
植物种子
2g
动物组织
0.2g
血清
1ml
体液
1ml
尿液
1ml
培养细胞
107个
微生物
107个
土壤样品
60g
案例解析:代谢组学和转录组学的结合揭示了前列腺癌的主要代谢途径和潜在的生物标志物
研究背景:乳腺癌是女性高发肿瘤,但是其致病机理研究尚不透彻。本研究基于临床癌组织及癌旁组织样本,结合转录组学及代谢组学(非靶向代谢组+靶向代谢组)技术深入探讨乳腺癌的致病机制,探寻潜在的小分子生物标志物。
研究思路:
主要结果:
参考文献:
Ren S, Shao Y, Zhao X et al., Integration of Metabolomics and Transcriptomics Reveals Major Metabolic Pathways and Potential Biomarker Involved in Prostate Cancer. Mol Cell Proteomics. 2016 (1):154-63. doi: 10.1074/mcp.M115.052381.
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